福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程、转录组线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在365天内选择参加同课...
福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程、转录组线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在365天内选择参加同课...
为了调查具有不同 DPS 水平的 GC 是否对新辅助化疗 (NAC) 表现出不同的反应,我们的研究招募了 82 名接受 NAC 的 GC。我们对 NAC 治疗后 DPS 低的 GC 的分析显示,53.8% 的 GC 表现出更好的治疗反应 (TRG > 2/3)...
单细胞测序技术的应用与数据分析、单细胞转录组为主题,精心设计了具有前沿性、实用性和针对性强的理论课程和上机课程。培训邀请的主讲人均是有理论和实际研究经验的人员。学员通过与专家直接交流,能够分享到这些...
这一篇文章的主题是深度学习在基因组学中的应用情况的。文章较长,读完要花些时间,不过我的建议是通读第一部分——关于如何进行模型训练的内容,读完后你应该可以理解机器学习模型的训练过程和逻辑,剩下的部分可以...
单细胞转录组之前是跟常规转录组一起开课的,但后来因为涉及内容多,也需要更专业的讲解,8月份第一次单飞独自开课,邀请中科院单细胞分析算法开发博士倾力授课,一鸣惊人,取得了很好的效果。现于2...
,我们在多个独立的黑色素瘤数据集中进一步剖析了这些关系,并评估了四种 TME 亚型("免疫耗竭"(D)-;由成孔蛋白家族(gasdermin)介导的细胞焦亡释放多种炎症细胞因子,由于其抑制肿瘤生长的有效性,在靶向治疗和...
参考:产品手册 PacBio三代全长转录组有什么优势? 近年来,随着高通量测序技术的发展,转录组测序已经成为研究基因表达调控的主要手段。但二代的转录本重构准确率很低,三代可以直接得到全长转录本,无需组装。可...
转录组分析的正确姿势 转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较,寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本,并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。...
在不同条件下获得的生物过程的时间序列转录组有助于识别该过程的调节因子及其调节网络。然而,这类数据是3D的(基因表达、时间和条件),目前还没有方法能够处理它们的全部复杂性。在这里,我们开发了一种避免在条件...
第八章新一代测序NGS:转录组分析RNA-Seq 8.4 转录组数据挖掘 转录组可以视为细胞特定时刻基因表达谱的一个快照,因此相关的研究通常包括定性和定量两个方面。定性研究主要鉴定出所有表达的转录本,定量研究则要...
欢迎关注”生信修炼手册”!在传统的测序技术中,上机测序的样本是由多个细胞构成的,最后分析得出的结论也只是基于所有细胞的平均水平,但是我们知道细胞是具有异质性的,对于大脑等复杂组织而言,其...
福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程、转录组线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在365天内选择参加同...
本文转载自“美格基因”,己获授权。推荐指数:★★★★★阅读时间:4分钟文本字数:1880字佳作推荐利用群落转录组拼接揭示参与深海碳氮循环的微生物Community transcript...
随着高通量生物技术的发展,已经开发了多种组学技术来表征不同但互补的生物信息,包括基因组学、单细胞、表观基因组学、转录组学、微生物组学和代谢组学等。 近年来,癌症相关多组学技术的快速发展 一直是人工智能...
在四周之前,我写了一篇推送一个月能通过转录组入门生信吗?,于是开启了我的‘四周通过实战入门转录组’计划。现在四周结束了,我对这个计划进行一个阶段性的总结。 答疑解惑 首先要感谢在过去的四周里,30多位加入...
单细胞转录组数据简介 单细胞转录组数据在生物学研究中扮演着至关重要的角色。随着技术的进步,单细胞转录组测序已经成为研究细胞异质性、发育过程、疾病机制等方面的强大工具。本章将介绍单细胞转录组数据的基本...
背 景 介 绍新一代测序技术的革新使得我们对生物体的组学信息有了更深的了解,随着转录组技术的日渐普及,尤其是单细胞转录组技术的突飞猛进,使得我们对组织内细胞异质性的认识有了很大提...
来自Manolis Kellis教授(MIT计算生物学主任)的课。本节课分为三个部分,本篇笔记是第二部分RNA structures。本部分深入研究了RNA转录的重构和测序技术。从RNA转录重构的基础开始,探讨了现代测序技术的应用。
高等教育基因组学73基因表达转录后调控PPT课件.pptx
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二) 收藏|北大生信平台"单细胞分析、染色质分析"视频和PPT分享 生信老司机以中心法则为主线讲解组学技术的应用和生信分析心得 - 限时免费...
单细胞转录组数据的质控与标准化对于确保数据的可靠性、可比性,进而准确分析细胞类型和转录组变化是至关重要的。 ### 研究目的 本文旨在介绍单细胞转录组数据的质控与标准化方法,重点讨论R语言在质控与标准化过程...
目标:随着高通量组学平台的发展,生物医学研究大多采取了多组学技术结合的方法,不同组学来源(如转录组学、蛋白质组学和代谢组学)的数据可以通过基于深度学习的预测算法进行整合,以揭示系统生物学的复杂工作。...
标签: 行业研究
随着生物技术的发展,元转录组学作为一种新兴的研究领域,为解决这些问题提供了新的途径。 ### 1.2 目的和意义 元转录组学是研究全基因组转录的方法,通过对细胞或组织中的所有RNA进行高通量测序,可以获取到细胞...
欢迎来GitHub上fork,... 比对软件很多,首先大家去收集一下,因为我们是带大家入门,请统一用hisat2,并且搞懂它的用法。 直接去hisat2的主页下载index文件即可,然后把fastq格式的reads比对上去得到sam文件。 接...
10X空间转录组做细胞通讯的打开方式