”转录组学习“ 的搜索结果

      分析目的:基于基因组比对结果,将相似的多转录本折叠成单个转录本(去冗余) PacBio分析软件: TAMA:https://github.com/GenomeRIK/tama TAMA简介 TAMA(T ranscriptome A nnotation by M odular A ...

     学习转录组学分析是一个很好的选择,下面是一个从零开始的学习转录组学分析的步骤: 1. 基础知识:了解基本的生物学概念和遗传学知识,包括DNA、RNA、基因表达等。可以通过阅读相关的教科书、参加在线课程或观看...

     虽然现在已经不再做生信但是作为对之前学习的总结,记录一下转录组分析的流程。 流程参考陈铭老师的《生物信息学》第三版。 (一)数据预处理 1.提取fastq文件:使用fastq-dump工具从SRA文件中提取fastq文件 ##...

     简单概括就是为了评估乙酰化对基因表达的影响,对野生型和突变体都做了转录组分析(基因差异表达分析和GO注释)。 1. 数据获取及质控 #1.脚本查看 $ cat dir_6.txt SRR3286802 SRR3286803 SRR3286804 SRR3286805.

     封面来源:https://www.zhihu.com/question/304747766常规转录组是我们最常接触到的一种高通量测序数据类型,其实验方法成熟,花费较低,是大部分CNS必备...

     RNA-seq工具哪家强RNA-seq分析工具知多少RNA-seq是研究转录组应用最广泛,也最重要的技术之一。RNAseq其分析内容包括序列比对、转录本拼装、表达定量、差异分析、融合基因检测、可变剪接、RNA编辑和突变检测等,具体...

     基于RNA测序技术的转录组从头拼接算法研究 摘要: 生物信息学主要研究分子生物学领域,而对于分子生物学领域,转录组的从头拼接又是其核心内容,即利用转录组的测序片段拼接出整个转录组中的所有表达的转录体。而RNA...

     上篇文章主要讲述了转录组测序的上传与检测完整性,今天的内容是如何远程连接服务器并且查看测序文件的结构。 补充上篇文章 一般做转录组测序都会做三个生物学重复。因为大多数老师都会让学生做重复,就忘记提了。...

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