如何快速学习单细胞测序 让自己得科研道路更顺利 理论+实操 零基础开始介绍
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(蓝色文字都可点击跳转到对应推文）转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较，寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本，并进行结果可视化...
今天分享一个转录组上游分析的流程，此流程的操作依旧是非常简单的。我们的流程主要使用软件的安装数据下载过滤比对Count等流程。
3. 数据整合：将预处理后的PRAT影像组学和转录组学数据整合在一起，这通常需要使用一些统计学或机器学习方法。 4. 特征选择：从整合的数据中选择最相关的特征，这可以帮助识别与PRAT相关的生物标志物和基因。 5. ...
单细胞转录组数据简介 单细胞转录组数据是指对单个细胞的基因表达情况进行测序和分析得到的数据。在过去，基因表达研究通常是对大批量细胞的总体测序，而单细胞转录组数据的出现为研究者提供了更为细致和准确的...
介绍单细胞转录组分析的背景 单细胞转录组分析作为当前生物信息学领域的热点之一，正在引起越来越多研究者的关注和重视。通过对单个细胞的转录组数据进行高通量测序和分析，可以深入了解细胞的功能、表型特征以及...
单细胞转录组技术是近年来迅速发展的生物技术领域之一，它允许研究人员在单个细胞水平上研究基因的表达情况，揭示不同细胞类型之间的转录组差异，帮助理解个体细胞在生物过程中的功能和调控机制。 ## 1.2 RNA修饰在...
基因表达的调控是通过基因调控系统实现的，这是一个复杂的系统，它是由基因、蛋白质、小分子信号和其他分子组成的，这些分子相互作用，并通过转录因子、miRNA等介导，影响基因表达。
[STEP1]逐一理解代码并按原样转录[STEP2]从一开始就通过查看转录的代码来转录[STEP3]学习并理解总体流程 对于竞争和内核选择，我们参考Kaggle Korea Yoohan 。 数据集 项目 1.泰坦尼克号 泰坦尼克号教程1-探索性...
近期学习转录组分析，从ncbi下载数据，转成fastq，STAR/hisat2 map到基因组上，使用featureCount拿到表达矩阵文件挺顺利的，就是到了下游分析，开始使用R开始遇到了各种问题。 原因是之前一直使用的一个docker 环境...
“福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次...
进入10x软件官网，下拉找到Cell Ranger，点击Download跳转至下载界面，该界面有Cell Ranger软件和参考基因组等资源，可以下载Cell Ranger软件压缩包上传至服务器，也可以复制这段代码在服务器下载。需注意的是，进入...
福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程、转录组线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在365天内选择参加同课...
单细胞转录组数据分析简介 单细胞转录组数据分析作为生物信息学领域的一个重要研究方向，为研究者提供了解析生物体内单个细胞基因表达的机会，揭示了细胞间的功能和表型差异。本章将介绍单细胞转录组数据的概念、...
空间转录组+单细胞核+单细胞ATAC联合分析揭示人心肌梗死多组学图谱
本系列课程学习的文章是：AKAP95 regulates splicing through scaffolding RNAs and RNA processing factors. Nat Commun 2016 Nov 8;7:13347. PMID: 27824034 很容易在文章里面找到数据地址GSE81916 这样就可以下载...
10X空间转录组与卷积神经网络（CNNs）
预先计算的诱饵转录组 tl; dr：快速是好的，但是快速和准确的更好！ 尽管预先计算的诱饵（<= v.14.2）仍与最新的主要发行版（v1.0.0）兼容。 我们建议您使用完整的基因组更新索引，因为它可以提供更高的准确性。 ...
GrapHiC-ML（基于图的Hi-C机器学习） 通过使用图形神经网络来选择脚本来分析Hi-C联系人数据。 正确的pytorch几何图形数据集的正确实现/创建需要ChIPseq和DNA甲基化数据以及Hi-C映射。 该数据尚未公开上传，但已在...
39个转录组分析工具，120种组合评估(转录组分析工具哪家强-导读版) 120分的转录组考题，你能得多少 年前开了一期二代转录组线下研讨班，效果挺好，大家学的很扎实，不少朋友又继续参加了后续其它内容的培训课程。...
单细胞转录组数据是指对单个细胞进行基因表达分析，可以了解不同细胞之间的遗传差异和功能差异。该技术的发展为研究细胞类型、亚型和功能等提供了全新的视角。 2. **R语言在生物信息学中的应用概述** R语言作为一...
群体转录组是我们最常接触到的一种高通量测序数据类型，其实验方法成熟，花费较低，分析思路简洁清晰，是入门生信，解决最常见问题的首选。单细胞分析是近几年的明星技术，多次被Nature、Sci...
单细胞转录组数据简介 - 1.1 单细胞转录组数据的概念 - 1.2 单细胞转录组数据的应用领域 - 1.3 单细胞转录组数据分析的重要性 在这一章节中，我们将介绍单细胞转录组数据的基本概念，探讨其在不同领域的应用以及...
“福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次...
单细胞转录组数据分析简介 - **1.1 什么是单细胞转录组数据？** - **1.2 单细胞转录组数据在生物学研究中的应用** - **1.3 数据挖掘在单细胞转录组数据解读中的重要性** # 2. R语言在生物信息学中的应用概述 R...
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