为什么我会走这个方案,说来很无奈,我只有个Windows系统的电脑,并且内存巨小,开虚拟机是不太够了,也没有Mac。但是许多很好用的Python库非要Linux系统不可,所以必须得解决这个问题。前前后后历时一个月,跌跌撞...
生物信息学包含生物数据分析、数据可视化、重复工作程序化,是生物、医学科研必备的技能之一。生信宝典精心组织生信学习系列教程、生信工具精品教程,通过大量的生信例子、关键的注释、浓缩的语句和录...
生信分析过程中,会与很多不同格式的文件打交道,除了原始测序数据fastq之外,还需要准备基因组文件fasta格式和基因注释文件gtf格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成,如bed、bed12、sam、bam、wig、bigwig...
2019年10月9日,单细胞转录组再等Nature。题为Decoding human fetal liver haematopoiesis的研究,对受孕后4周至17周的人胚胎肝脏、卵黄囊...
在分析处理流程中,会遇到一些代码段或命令执行出问题,一致处于未结束的状态,其原因可能使代码执行错误。在这种情况下,我们可以通过以下代码来实现超过规定执行时间的代码,强行结束,继续执行后续的代码。
对于生信分析人员来说,日常工作,软件运行,跑流程,均在linux下操作。当然,也有基于云端的生信分析平台,如免费的Galaxy,或者某些 公司的一站式云平台。 比较初学者学生物信息还是使用开源软件、学原理、一步...
生物信息分析软件很多是Java写的。软件在运行的时候就需要跨越不同底层操作系统(Windows/Mac OS/Linux)调用硬件,Java虚拟机(JVM)就是这样一个可以实现跨平台的接口。JVM是通过JDK软件虚拟的,JDK的安装包可以...
开源生信 R 教程http://www.ehbio.com/Bioinfo_R_course/1 思考题2 R基础2.1 R安装2.2 Rstudio基础2.2.1 Rstudio版本2....
生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-se...
我之前的文章说过,搞生信的理想工作设备是Mac电脑+Linux服务器,但是有些同学还是工作在Windows平台下,或者公司只配置了Windows电脑(这是常态)。这个时候,传统做法是先装...
win10自带子系统Ubuntu 安装方法详细记录 如果你恰好有相同的问题,欢迎阅读交流(●’◡’●)
天下事有难易乎?为之,则难者亦易矣;不为,则易者亦难矣。生信分两个大方向,偏程序开发和偏实际应用,程序开发需要较强的数学和 IT 背景,事实上这是一门叫作计算生物学的专业的主题,习惯上也...
生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流...
接触生信也有一段时间了,从一窍不通到现在(二窍不通),中间踩了不少坑。想了想还是写一本简单的入门教程,既能记录自己的学习历程,也能帮助到大家。 之后尽量每天写一小段!!!!!
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(2条消息)CSDN-资源上传 https://download.csdn.net/upload基于CiteSpace是一个...又需要电脑配置JAVA环境。这样给安装者带来了很多麻烦。我想这是软件开发者所不愿意看到的。为了更便捷一点,可以直接下载笔者为各位..
数据科学家被认为是21世纪最性感也是最具发展前景的职业,目前有75%左右的数据科学家使用R语言,有35%左右的数据科学家将R语言作为首选统计分析工具。今天,我们来了解一下R语言的前世今生。 R的诞生 1992年,肉丝...
在学生物的人看来,就是敲代码的,甚至要负责修电脑,而在计算机专业人士看来,还是搞生物的。 关于如何成为一个优秀的人,吴军老师说过,你要跨专业,一个专业做到前50%,另一个专业也做到前50%,那么你就进前25%了...
在广大粉丝的期待下,《生信宝典》联合《宏基因组》在2019年11月1-3日,北京鼓楼推出《宏基因组分析》专题培训第六期,为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个宏基因组分析学习和...
121个人电脑搭建微生物组分析平台(Win/Mac)本节作者:刘永鑫 中国科学院遗传与发育生物学研究所版本1.0.3,更新日期:2020年8月27日本项目永久地址:https://git...
开课背景 生物信息学说起来很好理解,可是对大部分想学习生信的人来...如今工具开发者(IT)和工具应用者(Biologist)的界限越来越模糊,只要您是生信领域的工作者,都需要了解生物信息学分析基本知识。 生物学家...