写在前面 Trimmomatic工具是用于illumina二代测序数据的reads处理,主要对接头(adapter)序列和低质量序列进行过滤。下面是使用该工具处理双端测序(PE)数据时,常用参数的一些说明。 参考文档 Trimmomatic工具的参考...
写在前面 Trimmomatic工具是用于illumina二代测序数据的reads处理,主要对接头(adapter)序列和低质量序列进行过滤。下面是使用该工具处理双端测序(PE)数据时,常用参数的一些说明。 参考文档 Trimmomatic工具的参考...
gis_temp_anomalies
注:从进入生信领域到现在,已经过去快8年了。生物信息学包含了我最喜欢的三门学科:生物学、计算机科学和数学。但是如果突然问起,什么是生物信息学,我还是无法给出一个让自己满意的答案。于是便有了这篇博客。...
Stepik练习-Coursera生物信息学III-UC Sandiego 运行所有测试 pytest --cov=....在本课程中,我们将学习用于对齐不同序列的算法 第一周 路线问题转化为“曼哈顿旅游”问题,即在矩形网格图中找到一条路径,该路径可以...
bioinfo train data
Bioinfo_IntersectionPartition用法编译制作跑步chi -b“ bam文件路径” -v“ vcf文件路径” -o“输出文件路径”输出信息最佳分区ID:分区问题的最佳解决方案
2021-M5Bioinfo 2021年2月在海德堡大学开设的M5:生物信息学课程中的“统计与机器学习”模块的材料课程议程该模块包括四个部分,如下所示。 每个部分包括一系列视频讲座(mp4 / mov),幻灯片(PDF)和练习,形式为...
2020/21年生物信息学项目:UNet与HQA进行生物医学图像分割去做: 数据集类前处理静态(在训练之前扩充数据集) 动态(在训练过程中增加数据集) 静态+动态(??) 优尼特模型(〜完成) 训练记录中结果可视化HQA...
Bioinfo_c_Scripts生物信息学的C脚本nt_count.c 打印输入序列的核碱基组成用法$ gcc nt_count.c -o nt_count$ ./nt_countnt_histogram.c 打印输入的DNA序列的核碱基组成的水平直方图用法$ gcc nt_histogram.c -o nt_...
K均值 作者: 约书亚·马丁(Joshua Martin) 费德里科·莱昂内蒂(Federico Lionetti) 名为cicio的文件是我们对作业03的解决方案。
标签: Java
生物信息 生物信息学项目由: Opsommer 苏菲 瓦蒂隆·蒂博
Bioinfo-C是基于对象的免费集成(LGPL)C代码,可有效开发生物信息学应用程序。 目前(2013年6月)的目标受众是框架开发人员。 计划扩展到应用程序开发人员和生物学家。 2017年4月,主要开发人员去世了。 目前,...
2020Bioinfo.github.io
生物信息生物信息项目 M2 ILC
生物信息学工具每个子文件夹中提供了更多详细信息。MLGtest.R根据观察到的独特多基因座基因型的数量来测试人群中无性繁殖的发生。 这是非常保守的,请参阅自述文件中的一些注意事项。 pileVar.pl识别变体基于从...
IU批处理脚本是Shell脚本,可简化在使用PBS排队系统的Unix计算机上和在使用LoadLeveler的AIX计算机上提交批处理作业的过程。
1. 无监督学习 3. 优化目标函数 4. 随机初始化 5. 选择聚类的数量
apostila_bioinfo 生物信息示范典范
master-bioinfo-bordeaux.github.io 网站代码,提供与法国波尔多生物信息学理学硕士相关的所有信息。
资源来自pypi官网,解压后可用。 资源全名:sos_bioinfo-0.9.10.1-py3-none-any.whl
bioinfo_tp2生物信息-TrabalhoPrático2
这是哈佛大学STAT115 / 215 BIO / BST282的课程材料。 它是基于R Markdown和bookdown ( )创建的。
1. Basic counting principle 3. Combinations: Binomial coefficient 二项系数 4. Binomi
该存储库引用了一组通用的生物信息学实用程序,我发现这些实用程序在过去几年中适用于我的工作。 某些脚本可能未针对效率进行优化。 它反映了我的自我学习过程以及随着时间的变化。 :) 从其他地方导入的Perl脚本。
bioinfo_gui_scripts 可以轻松转换成GUI程序的python脚本,供湿实验室的科学家使用(请参阅Wiki页面以获取文档和技巧)
一些可疑和务实的基准此存储库包含用于评估要用于字符串密集型程序(生物信息学)的语言的代码。 基准测试并未试图找到解决文件中字段数量计数问题的最快方法,它们只是用来演示以下内容: 可脚本编写性-从stdin和...
生物信息脚本 由Kovach实验室开发和使用的脚本记录,用于处理测序数据。 到目前为止,该存储库包括: 1.)BioinformaticBookkeepingSlurmTemplate.sh-一个示例Slurm调度程序模板,用于生成生物信息“纸迹”并...
BioLeetCode让我们以刷LeetCode题目的形式,来编程解决生物信息学问题吧,Come on查看题目(不定期发布):另外,欢迎大家把有意思的生物信息学编程问题提交到这里
山东大学计算机科学与技术学院生物信息2023实验